Богат мир растений Тункинского национального парка. Но господствующим типом растительности здесь являются леса. Именно лес оказывает на природную среду наибольшее влияние. Более 60% всей территории парка покрыто кедрово-лиственничными и сосновыми лесами, причем первые значительно преобладают. В меньшей степени распространены леса из ели сибирской, пихты, березы, осины, тополя и древовидных ив. Распределение растительности подчиняется закономерностям высотной поясности, включающей 6 поясов: лесостепной, подтаежный лесной (горно-таежный), подгольцовый, гольцовый и нивальный (снежный или каменный). Из них три последних относятся к высокогорному типу ландшафта.

Интересен животный мир национального парка. На его территории обитает более 310 видов позвоночных животных, относящихся к 5 классам: 54 вида млекопитающих (6 отрядов), 18 видов рыб, 4 вида земноводных, 5 видов пресмыкающихся. 

 
В лесах водятся различные хищные и пушные звери, копытные и грызуны. Здесь встречаются медведь, снежный барс, волк, лиса, рысь, росомаха, барсук, соболь, хорек, горностай, ласка, заяц-беляк, белка, бурундук, полевки, бурозубки, пищуха, ондатра, сибирская косуля, кабан, марал (изюбрь), лось, кабарга, сибирский горный козел, северный олень. 

Птиц насчитывается 237 видов. 17 отрядов из них: гнездящихся – 207 (глухарь, тетерев, бородатая куропатка, белая куропатка, кряква, серая утка, чирок-свистунок, хохлатая чернеть, трехпалый дятел, удод, хищные – канюк, черный коршун, тетеревятник); пролетных – 17 (тулес, гаршнеп, турухтан), зимующих – 5 (белая сова), залетных – 6 (обыкновенный фламинго, кудрявый пеликан). К редким видам птиц, занесенным в Красную книгу Республики Бурятия относятся 93 вида, из этого количества видов, 55 обитают и встречаются на пролете в Тункинском национальном парке, в том числе 17 занесены в Красную книгу Российской Федерации. В национальном парке можно встретить следующие виды редких птиц: черный аист, касатка, серый гусь, горный гусь, каменушка, скопа, черный гриф, беркут, большой подорлик, орел-могильник, орлан-долгохвост, сокол балобан, сокол сапсан, алтайский улар, журавль красавка, серый журавль, филин, белая сова.

Посетителям национального парка предлагают различные виды туров маршрутов и экскурсий по длительности, типам передвижения и цели посещения.
Особой популярностью пользуются маршруты на минеральные источники (Аршан, Нилова Пустынь, Шумак, Хонгор-Уула и т.д.); восхождение на Мунхэ-Сарьдаг; сплавы по рекам Иркут и Зун-Мурино.